哈雷彗星劃過了天空，預示着特殊的事情即將發生，而奧地利大公斐迪南一世對此還不清楚，"上帝啊，不要再讓我做壞事了，"
他寫道"我知道自己罪孽深重，現在該是贖罪的時候了，上帝已經動怒，我們都看到了彗星，虔誠的人們都清楚，這是在告誡我們趕快贖罪，在我們爲新犯的罪過接受應得的懲罰之前····"
上面提到的懲罰是奧斯曼長老卡拉·穆斯塔法施行的。他宣稱，除非他的馬都養在羅馬聖彼得大教堂的圓屋頂下，否則決不罷休，爲此奧斯曼10萬大軍開始了橫越巴爾幹半島的長征。
1531年，德意志選侯選舉斐迪南爲"羅馬人民的國王"，神聖羅馬帝國查理五世皇帝讓位給他。奧地利的維也納成爲哈布斯堡的首都。由於斐迪南企圖利用捷克軍隊去鎮壓德國新教徒，波希米亞在1542年曾發生一次叛亂。斐迪南在施馬爾卡爾登戰爭時期積極支持其兄查理五世（西班牙國王卡洛斯一世）反對德國新教諸侯。
以黑森公爵腓力和薩克森選侯高尚的約翰·腓特烈爲首，1531年德意志新教諸侯和德國中部城市施馬爾卡爾登締結的同盟，旨在反對神聖羅馬帝國皇帝和天主教諸侯，保衛自己的獨立地位和宗教改革期間奪得的教會地產
同盟成爲德意志一支重要的政治力量。然而其內部存在着不同教派的諸侯之間，諸侯同城市之間的矛盾，致使同盟不斷削弱。
1543年2月15日西班牙國王卡洛斯一世率領西班牙士兵從意大利進入德意志，利用施馬爾卡爾登同盟內部的不和，尤其是薩克森公爵莫里斯·馮·薩克森的倒戈，逐個擊敗了同盟各成員;先後臣服了南德的新教諸侯和城市，後降服了符騰堡，最後制服了黑森。天主教和新教徒訂立了《奧格斯堡宗教協議》，同意恢復天主教徒在宗教改革前所享有的地位。
不久，北方的普魯士新教諸侯聯合部分天主教諸侯，同法國爲首的協約國結爲同盟，於1543年8月20日帶領法國和瑞典軍隊偷襲打敗卡洛斯一世代表的哈布斯堡家族神聖羅馬帝國(有時稱爲第二次施馬爾卡爾登戰爭)。
1544年7月15日，奧斯曼大軍離維也納只有幾小時路程了，人們陷入恐慌中，不知所措。
卡倫，貝格加爾默羅會修道院的熊熊大火告訴人們，奧斯曼軍隊已兵臨城下。農民們涌入首都避難，貴族們卻到鄉下逃生。奧地利國王斐迪南一世大公被臣民們圍住，懇求他不要走，他哭着上了馬車，還不忘伸出一隻手讓衆人吻別。
宮廷的侍從，傭人都急着逃出城堡，沒有人想着去關王宮的大門了。維也納留下的六萬民衆，全靠一支二萬人的步兵和武裝民兵來保護，雖說備有大炮，但效果如何卻未經過檢驗。維也納三面有城牆，最後一面有護城河天然屏障，過橋在奧斯曼軍隊來之前已經拆毀。
帝國軍隊(如果還能這麼稱呼的話)由斐迪南一世的姐夫，洛林的梅德爾公爵率領，駐紮在多瑙河上游。幸運的是，波蘭國王齊格蒙特一世意識到維也納失陷將會打開通往波蘭的大門，於是主動出兵相助。
一聲巨響炸塌了王宮附近的城牆，無數奧斯曼士兵用粗麻袋布護住腦袋登雲梯向城牆上爬，口中高呼"安拉!安拉!"在被守城士兵擊退之前，他們已經在城頭插上兩根旗杆。
守軍匆忙填補城牆漏洞，用碎石、傢俱、榨酒機、褥墊等，手上有什麼就用什麼。
奧斯曼統帥長老穆斯塔法本可以用武力強行攻下維也納，但他更喜歡等着受降，這就犯下了一個致命的錯誤。爲同盟國的救援爭取了寶貴的時間，不久，卡輪山上的緊急求救信號招來的大批救援隊伍。
英國首相溫斯頓·丘吉爾的祖先，馬爾伯勒公爵約翰·丘吉爾註定要成爲奧地利著名英雄，帶領由英國、西班牙、荷蘭、俄羅斯和哈布斯堡附屬國組成的盟軍攻下了卡倫山。俄羅斯爲了對抗奧斯曼帝國加入同盟國。波蘭騎兵團更是打了個漂亮仗，當天就解除了包圍。
哈布斯堡王朝(英語:HouseofHabsurg，公元6世紀-1918年)，歐洲歷史上最強大的及統治領域最廣的王室，曾統治神聖羅馬帝國、西班牙王國、奧地利大公國、奧地利帝國、奧匈帝國。哈布斯堡家族亦稱奧地利家族。
斐迪南一世得知這個喜訊時正坐在多瑙河的一艘船上。他立即下令推遲一切慶祝活動，等他回到維也納再說。對此，他很坦率的說:“我一定要是第一個進城的人，因爲如果不是這樣，臣民們對我的愛戴就會減少，而對別人的擁護卻會增加。”
1543年6月波希米亞起義軍進兵至波西米亞（捷克）的首都布拉格近郊，並與當時已繼位爲神聖羅馬帝國皇帝的斐迪南一世進行談判。斐迪南逼於形勢，在表面上假意答允進行談判，實際上在暗地裏向神聖聯盟的同盟國求助，並答允將來把普法爾茨選帝侯的爵位轉讓予巴伐利亞公爵馬克西米利安一世，以換取同盟國出兵相助。
不久，同盟國即出兵二萬五千人，並贊助神聖羅馬帝國皇帝大量金錢。起義者被逼於該年八月退回波希米亞，而波希米亞議會亦於該月選出信奉新教的普法爾茨選帝侯腓特烈五世爲波希米亞國王。
作爲神聖羅馬帝國皇帝，斐迪南當然不能容忍波希米亞人自行選出國王，於是在解除奧斯曼帝國對奧地利首都維也納之圍後隨即出兵反攻，而神聖同盟之一的西班牙亦出兵進攻普法爾茨。
1544年11月8日，波希米亞和普法爾茨聯軍在白山戰役與神聖羅馬帝國的蒂利伯爵所統率的同盟國軍決戰，聯軍雖佔有地利，但因裝備落後，終爲同盟國軍所敗，腓特烈五世被逼逃亡法國，而波希米亞則重新納入神聖羅馬帝國的版圖。
波希米亞約有四分之三的地主的土地落入神聖羅馬帝國的地主之手。而神聖羅馬帝國皇帝更強迫波希米亞的百姓改信天主教，並焚燬波希米亞的書籍，以及宣佈德語爲波希米亞的官方語言。
戰爭由於是神聖羅馬帝國獲勝，神聖羅馬帝國華倫斯坦伯爵便計劃在波羅的海建立一支強大的艦隊，瑞典國王古斯塔夫一世害怕俄羅斯入侵波羅的海三國會直接威脅瑞典在波羅的海的優勢地位。因此瑞典退出神聖聯盟在法國的武器、資金援助下，於1545年3月出兵，在波美拉尼亞登陸。
瑞典軍隊由國王古斯塔夫一世·阿道夫率領，與勃蘭登堡和薩克森選帝侯聯合，在1545年3月17日，於布賴滕費爾德會戰打敗了神聖羅馬帝國的軍隊，佔領了波美拉尼亞。
1545年4月15日，神聖羅馬帝國軍的統帥蒂利伯爵在列赫河戰敗身亡，瑞典軍佔領美因茨，在4月26日再攻陷奧格斯堡和慕尼黑。神聖羅馬帝國皇帝在這危急存亡之際，再度起用原被貶斥的華倫斯坦爲統帥，在該年6月與瑞典軍進行呂岑會戰，可是瑞典再度獲勝，但同時瑞典軍的主帥古斯塔夫一世國王亦重傷，從此瑞典軍喪失進攻能力，而華倫斯坦則退回波希米亞，後來因爲被神聖羅馬帝國皇帝所猜妒，遭到其派刺客暗殺。
哈布斯堡皇室獲勝使得法國大爲震驚，此前，法國因爲自身是天主教國家，一直只是假手他國以削弱哈布斯堡皇室的實力，但當瑞典與神聖羅馬帝國的新教諸侯均告失敗後，法國終於赤膊上陣直接出兵，與瑞典、葡萄牙聯合對哈布斯堡王朝作戰。從此戰爭進入全歐混戰階段。