城牆上擠滿了清軍，通道被堵死，相互之間難以支援。
張存仁看明軍駕船來攻，便知道城池完了。
於是連忙向後溜走，數百親兵則堵住城牆，同方國安的人拼死激戰。
城牆上到處都是清軍，通道被密集的人羣堵死，明軍要追上去，必須要將城牆上的清軍殺散。
這時，其它各面上，明軍乘坐竹筏，開始全面攻城，士卒首先以箭矢火銃，射殺城頭清軍，守軍在漫天箭雨中，紛紛跳入水中，想要滑水逃離。
城頭令一處，剛送走黃澍的馬光輝，正拼死抵抗着明軍的攻擊，可是守軍卻被殺得節節敗退，急得馬光輝揮刀大聲急吼：“抵住，給我頂住！”
這時一名傳令兵卻疾奔過來，對馬光輝道：“軍門，南城已經失守，總督大人讓軍門殿後。”
馬光輝大驚，急問道：“張中堂在哪裏？”
“總督大人現在已經去往北門！”
馬光輝臉上肌肉抽搐，看見明軍架着竹筏衝到牆邊，一個手雷投上城牆，城牆上的清軍就被炸翻一片，城上爲之一空，明軍趁機上城，揮刀砍殺清軍，清軍士卒無心戀戰，要麼跪地投降，要麼跳入水中。
馬光輝長嘆一聲，周圍清軍目光注視他，都是一臉憤恨之色，準備與明軍拼了。
馬光輝卻忽然轉身，低沉怒吼，“快撤！”
北城，張存仁拆了城樓，又找了一些木板木材，紮了數十條筏子。
“中堂大人，快走吧！”清軍聽見喊殺聲，看見已經有明軍筏子進入城中，急聲諫言。
張存仁輕輕嘆息一聲，“馬軍門沒來嗎？”
周圍軍官都搖了搖頭，“馬軍門掩護中堂撤離，中堂還是先走吧！”
張存仁目視成爲澤國的杭州城，嘆息一聲，登上筏子，領着數百人向北逃離。
筏子無帆無槳，不過好在洪峯向北傾瀉，帶着筏子向北而去。
茫茫一片濁水中，漂浮着浮木，還有人和家畜的死屍，數十個筏子，每個筏子上擠滿了清軍，倉皇北逃。
筏子上的清軍大多丟棄了盔甲，相當一部分人，還丟掉了兵器，以便筏子能乘坐更多人。
這時一行人剛離開城池沒多久，後方便一陣喊殺聲傳來，筏子上的清軍頓時一聲驚呼，“不好，賊軍追來了。”
驚魂未定的張存仁，回首一望，便見身後有明軍乘着小船追殺上來，心頭立時一沉，急聲大喊，“快，往前劃！”
清軍士卒看見明軍追至，一個個肝膽俱裂，趴在筏子上拼命划水，可是身後的船隻卻依然越來越近。
不多時，船隻便追上清軍筏子，可是上面的人卻沒有放箭射殺清軍，而是同樣拼命划水，從清軍筏子旁邊超過，甩給清軍一個背影，向北劃去。
“是馬軍門！”筏子上劃得手臂發酸的清軍，站起身來，看見遠去的幾艘小船，臉上露出不可置信之色。
張存仁臉色一沉，“豈有此理！馬光輝負責殿後，居然殿到本督前面去了。”
筏子上的清軍站起身，看着馬光輝駕船跑到前頭，而正在這時，身後一片“砰砰砰”的火銃聲響起，站起身的清軍紛紛背後中彈，跌落入渾濁的洪水中。
筏子後方，明軍船隊追殺而至，開始射殺清軍，張存仁憤怒的看了消失的馬光輝一眼，知道木筏的速度比不上明軍小船，帶着一絲絕望的怒吼道：“衝到前面土丘上去。”
筏子上的清軍不斷被明軍射死，屍體落入水中，在渾濁的洪水中泛起一朵朵殷紅。
清軍拼命划着筏子，衝到一處沒被淹沒的山丘下，筏子直接撞上去，清軍士卒連滾帶爬的跑上山丘，明軍戰船划來，張名振揮手大喝：“圍起來！”
黃昏時分，杭州城內的戰鬥已經進入了尾聲，一羣羣清軍俘虜被收繳兵器，綁在城頭。
明軍士卒乘着小船和竹筏，穿行於城中，逐一清理屋頂的清軍，救助受災的百姓，將人員轉移高處。
朱以海並未進入杭州城，而是在數百親衛的簇擁下，在張煌言等人的陪同下，查看河堤缺口。
此時，得知杭州被攻下後，數千明軍和近萬民夫，已經開始往缺口丟土袋、石塊，意圖堵住缺口。
“杭城既下，便需要儘快救治災民，而要救災，首要便是封堵缺口，疏通水道，使洪水儘快退卻。”朱以海心情頗爲沉重。
張煌言道：“殿下，各處已經派出兵馬和民壯，封堵決口，拉開土袋疏通水流，最多兩三日間，洪水就能消退。”
朱以海點了點頭，繼續說道：“這次很多百姓慘遭不幸，官府要立刻進行救治，另外大災之後，需要防止大疫，各州縣都要提前做好準備。”
張煌言作揖道：“殿下放心，之前便轉移了大批百姓，受災的主要是杭州附近的百姓，大軍正將他們向高處轉移。臣以令士卒，處理屍體，並借調東海軍的醫官隊，進入各縣防備疫情出現。”
“災民聚集一處，難免有人渾水摸魚，傳令各軍，但凡被抓住有搶劫、傷人，姦污罪行的敗兵一概處死，大明將士犯法同罪！”朱以海沉聲囑咐。
這時，一隊士兵駕船靠近岸邊，從船上擡過來一具屍體，屍體放在擔架上，用白布蓋着。
老帥張名振跳下船，來到朱以海身邊，抱拳一禮，“啓稟殿下，馬光輝那廝溜了，不過臣困住了張存仁！”
說完，張名振拉開白布，露出一具面色慘白的屍體，身體身上遍佈血洞，脖頸處一道長長的傷痕，令人觸目驚心。
張名振解釋道：“臣追擊馬光輝途中，撞見了張存仁，將其困於一座矮丘，四面圍攻之下，清軍殘軍盡數被殺，張存仁被火銃射傷，自刎于山頭。”
朱以海上前打量了張存仁的屍體一眼，當年他第一次攻擊杭州，就是敗在此人手中，折損數萬將士，此後一蹶不振，又被清軍橫掃了浙東。
現在看見張存仁的屍體，朱以海心中並無快感，只是下令道：“割其首級，傳首全浙！佈告天下，孤王以復杭州。”
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