呂宋反叛的消息，很快傳回了京城。
萬曆皇帝在氣憤之餘，又感到有些慶幸一正好可以藉此機會，轉移一下國內的矛盾，尤其是他和大臣之間的矛盾。
自從礦監稅使肆虐天下，他就陷於大臣無休止的口誅筆伐之下。
萬曆皇帝內功了得、置若罔聞，但他的大臣們可是要臉的，眼見着虎狼當街，百姓ng難，他們這些爲民父母的朝廷命官卻束手無策，愛莫能助，便紛紛上疏求去。
其實這股辭官風潮，從萬曆九年便已經出現。自從沈閣老失蹤後，萬曆皇帝便一心想要獨裁，自然與文官集團發生ji烈的衝突，儘管皇帝有着先天優勢，無奈好虎架不住羣狼，數次鬥爭，都以文官的勝利告終。
萬曆的驕傲和執拗，使他不知“妥協，爲何物，就算文官把他擊敗了，也休想使他服從擺佈。於是熱戰之後，雙方進入了冷戰期，萬曆皇帝朝講不御、郊廟不親、章奏不批、缺官不補更缺德的是，他抓住機會就罷黜大臣。
曾經有一位shi郎，只是因爲奏章中出現了錯別字，便被萬曆抓住小
辮子猛批不批奏章，不代表他不看。不看不批，大臣可以代批，還不算太壞。看了不批，就像站着茅坑不拉屎，才真叫噁心人呢萬曆把錯別字上升到工作態度疏忽，對皇帝極爲輕視的高度，那位可憐的shi郎自然要上疏請辭。大臣紛紛上書挽留，萬曆卻連象徵xing的慰留都沒有，直接准奏，捲鋪蓋趕回家
萬曆當時想的是，三條tui的蛤蟆不好找，兩條tui的人有的是，把那些討厭的傢伙攆走了，正好換上自己中意的人選。然而文官們豈會讓他得逞別忘了四品以下官員由吏部鈴選，三品以上官員由廷推產生，大臣們就是不選皇帝中意的人選，他們推薦的人選，皇帝又不中意。
萬曆也不是沒想過用過中旨，繞過外廷直接任命官員從法理上講，這是行得通的，然而這是士林最不齒的事情，誰要是敢接受中旨任命，朋友立刻跟他斷絕往來，出門就有人扔臭雞蛋，到衙門上班，也會被同事和上司排擠。總之一句話，你會體會到什麼叫衆矢之的，什麼叫生不如死的。
所以萬曆一吹出風去，那些“幸運，的官員便嚇破了膽，連連上書敬謝不敏，逼得急了，直接掛冠而去，不給皇帝揠苗助長的機會。
但是大臣們推薦的人選，也甭指望走馬上任，因爲栓選也好、廷推也罷，只有推薦權，沒有決定權，最終還得皇帝出聖旨纔算完成任命。
於是我用不了我的人，你也甭想用你的人，雙方就這樣對耗起來。
萬曆九年，兩京缺尚書三人，shi郎豐人，科道九十四人，地方上缺巡撫三人，布、按、監司六十六人，知府二十五人。三年以後，南北大僚強半空署，督撫重臣經年虛席，藩臬缺至五六十人，知府缺至四五十人。
鼻近這段時間，因爲對礦監稅使無能爲力，剩下的大臣也基本歇菜了掌管全國庶政的閣部院大臣中，內閣僅剩下申時行和王家屏。
九卿中在朝供職的，只有都御史一人和shi郎二人，餘則或因缺未補，或杜門不出，朝政已然癱瘓。
萬曆皇帝這才慌了神，畢竟他倚仗的內廷太監，抓人斂財是好手，講到治國就抓瞎了。祖宗江山還得靠文官打理，所以他已經有些後悔了，只是死要面子不肯主動妥協，而呂宋反叛事件，正好給了他就坡下驢的機會至少萬曆自己是這樣想的。
因爲即使放在歷史長河中比較，本朝大臣也是一頂一的臭又硬，一旦涉及領土和主權，沒什麼好說的，半定是喊打喊殺，顧不上跟自己鬥氣了。
但皇帝失算了，消息傳開後，那些“又臭又硬，的大臣，竟然十分罕見的對呂宋持理解態度，而將責任一股腦算到萬曆皇帝的橫徵暴斂、
貪婪無度上。
萬曆下令廷議平叛，這次大臣們能到場的都來了。可是討論的結果讓萬曆極爲不滿大臣們一致認爲，不可貿然出戰。他們說呂宋與本土遠隔重洋，且有強大的艦隊保護，不可貿然征討。須得建造戰艦，編練水軍，儲備物資、謀定後動。而且當前國內狼犬當道、民怨沸騰若斯，大興兵戈的話，恐怕會引發民變。
大臣們說，呂宋畢竟孤懸海外，無法危及統治的根本，若是各省亂起來，國家就真的危險了。所以他們聯名上書，請求皇帝撤銷礦監稅使，修明政治、與民休息，先將兩京十三省的高燒退下去再說。
大臣們對呂宋叛亂的處理意見，是遣使嚴加申斥，如果呂宋方面是一時糊塗，看到觸怒天威，自然會幡然悔悟，自縛請罪。如果呂宋方面執不悟，則可ji起全國民衆的怒火，到時候就算要打仗，民衆也會全力支持。
簡單說來，大臣們就一個意思不先把礦監稅使的問題解決，別的問題只能拖着。
但在萬曆看來，呂宋的叛亂太遙遠，動搖不到自己的龍椅。
用礦監稅使摧毀工商業、打擊東南豪族，纔是維繫皇權根本的第一要務，所以他萬萬不會上大臣的當，在大好的局面下半途而廢的。
於是，君臣間又一次陷入了互不相讓的死結，征伐之事自然遙遙無期。緊接着，長江以南地區發生了大規模抗稅暴動，也將朝野上下的注意力，從遙遠的呂宋轉回國內
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嘉靖中葉以來的工商業大發展，帶來了一輪快速的城市化。尤其是東南發達地區，城市的數量迅速增多，城市
的人口急劇增加，深刻的改變了大明朝的社會形態，也改變了許多看不見、不着的東西。
與在農村生活的農民相比，城市裏居住的市民，對暴政和危機的忍耐力要低很多。這不是因爲他們的個人意識覺醒，思想覺悟有多高而是因爲他們脫離了土地一切生活資料都要靠勞動報酬來購買。
一旦遇到經濟蕭條、商號大面積倒閉，城市中的工作機會便會急劇減少。失去工作的工人，就面臨衣食無着的處境。如果再遇上金融風暴，將他們的積蓄一卷而空，工人們就徹底沒活路了。
在不知失業救濟爲何物的當時，城市變成了火藥桶，絕望的市民便是桶中的火藥，只需一根導火索，一個火星就足以引爆。
然而最早的暴動，卻發生在工商業相對落後的湖南長沙。
在長沙搜刮的稅使叫馬堂他以四十萬兩的價格，買下了這個差事。比起其他大城市動輒百萬的成交價，這個價格顯然是賺到了。只是這位仁兄忘記了就在兩年前，聽聞何心隱被捕，蜂擁而至的湖南民衆，將東廠衙門包圍的水泄不通。