.表面上看，落實陳五事疏，是爲了安定人心，向遍佈朝野的高黨中人證明，沈氏內閣還是會按照前任首輔的路線走下去。因此不會有大範圍的人員更迭，大家可以繼續安心當官。
其實明眼人都知道，落實陳五事疏的過程，就是內閣權力擴大化和合法化的過程。因爲陳五事疏所提的五條御門聽政，設案覽章，事必面奏，按章處事，章奏不可留中看起來是一份皇帝練習政務的詳細指南。但實際上，卻是一份要求權力的政治綱領。
時下所謂入閣拜相，即官員成爲內閣大學士後，朝野便以宰相視之。不僅老百姓和官員這樣認爲，就連皇帝也公然在諭旨中說汝等名爲閣臣，實爲宰相但這一切都改變不了一個事實，那就是他們並非真的宰相。
因爲本朝不設宰相，內閣大學士雖代行相權，但從制度上來說，這種做法實有曖昧不明之處其實大學士本身只有五品，原屬文學侍從之臣，其職責爲替皇帝撰擬詔誥，潤色御批公文的辭句，說白了就是皇帝的機要祕書。雖然後來內閣的職權就由於處理政事的需要而越來越大，大學士一職也愈向前朝宰相看齊，但始終無法擺脫有實無名的尷尬他們其實是在替皇帝批答奏摺，以皇帝的名義出詔令，其與司禮監的宦官殊無二致。
權力來自皇帝，就意味着皇帝可以隨時將你罷龘免，斷絕你的權力。
現在皇帝只有不到十歲，沈默倒不虞自己突然被罷龘免，但也正因爲如此，再以皇帝名義下達政令，難免會被朝野質疑這到底是皇帝的意思，還是你沈閣老的主意
還是那句話，名不正則言不順，言不順則事不成。先將手頭的權力合法化，再名正言順的行使，這纔是王道。最有利的條件是，這件註定要找罵名的事情，已經由高拱做完了最艱難的部分一個月前，便以皇帝的名義批紅成憲，並在邸報刊發。
沈默只需要打着高拱的旗號，切實落實下去便可。
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首先是落實御門聽政，鑑於皇帝正處在長身體、學知識的年紀，每個月只在朔、望兩日上朝兩次，不必過問平日政務，只有發生大事的時候，才由皇帝召集內閣、部院大臣共同解決；如果沒有大事，那麼請太后和皇帝就安生地休息，靜等皇帝長大。
然後是設案覽章，規定內侍官每日設御案，擺上最新收到的奏章，然後出門，待御覽畢，發內閣擬票。內閣票擬後再行呈覽，皇帝認爲沒問題，即可批紅髮行。這是爲了讓皇帝練習政體，更是爲了向天下人表明，一切旨意皆出聖裁。
第三是事必面奏，與第二條是同樣用意。
重點在第四，第五條，按章處事和章奏不可留中，上，這兩條規定了皇帝的批紅必須以票擬爲準，若票擬不和聖意，可以打回重擬。如果有未經票擬徑自內批的情況，請允許內閣大臣執奏明白方可實施。而且皇帝不能扣住奏章不發，倘有未發者，容原具本之人仍具原本請乞明旨。爲此命通政司在進封奏章時，應將當日奏章數目，開送六科備照，倘有未下者，由科臣奏討明白。
這後兩條，其實是很招人眼的，原本哪怕是高拱時代已經提請獲批，現在落實下去，也會招致軒然大波。然而因爲之前馮保一區區閹豎，險些矯詔罷龘免了首輔，令朝野無不震驚。所以這兩條政令，便被視爲是對馮保事件的痛定思痛，防止司禮監再次作亂而設。
沈默利用了對宦官干政聲討的浪潮，將司禮監的權柄收歸內閣，待到浪潮退去，人們冷靜下來，也只能苦笑着接受了畢竟，皇帝這麼小，權力操之於內閣，總好過在死太監的手裏。
至此，帝國最高行政機構，終於完成了權力的轉移，內閣獨攬大權，再無司禮監掣肘至少在皇帝勤政以前，位於皇城東南角的文淵閣，就成了大明朝真正的權力核心。
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落實陳五事疏以後，另一件事情也刻不容緩了。那就是高拱去後留下的權力空白，需要馬上填補。
首先，高拱原先除首輔外，還兼任吏部尚書。現在天官出缺，經由廷推之後，朝中最負重望的大臣楊博，接任了這個職位。
這時候，久病的大學士高儀去世了，加上張居正病休，內閣中只剩下沈默與張四維兩個。增補大學士刻不容緩，經過廷推之後，吏部左侍郎魏學曾、禮部左侍郎諸大綬、右都御史陸樹聲入閣。
高儀還空出了禮部尚書，由南京禮部尚書孫鋌接任。
在這一系列人事變動中，沈默始終謹守着廷推的原則，並未干涉過人選的確定，並且通過聖旨明確規定，今後凡是四品官員的任命，必須由吏部尚書主持會推，三品以上官員，必須經由內閣大臣和部院長官廷推方可任命，其他方式無效。
這本就是約定俗成的規矩，沈默只是以聖旨的形式，將其法令化和確定化。而且沈默凸顯了吏部尚書的職權，並未使內閣一家獨大，而是實行中樞機構的二元制，即天官和受輔分權制衡，這讓楊博十分的滿意，也堵住了說他要獨裁的悠悠衆口。
在入閣人選上，除了諸大綬之外，魏學曾和陸樹聲，都不算沈默的親信，這又讓人看到了首輔大人的一顆公心。然而實際上，魏學曾號稱大炮，陸樹聲是嘉靖二十年的會元，都是出了名的道德之士，兩人有個共同的特點，那就是沒有私黨，也不會結黨。一個月後，刑部尚書馬自強致仕，由本部左侍郎孫鑨接任。諸人以外，工部尚書朱衡、左都御史葛守禮
留任。至此，京中內閣、六部和都察院的大僚確定下來，沈默便適時推行他的以用舍刑賞還公論，規定但凡軍國大事、國策制定等朝廷重大事項，必須經由廷議，如果無法議出結果，則以投票決策。像廷推一樣，廷議自來就有。至於投票決策，這也不是新鮮玩意兒了，當年封貢議和之時，高拱便玩過這手，當時便十分順利的推行，現在沈默將其固定下來，自然也沒什麼阻力。
最初百官擔心，沈默將司禮監手中的權力收歸內閣，會不會展開前無古人的獨裁，那樣不管他沈閣老多麼德高望重，百官也不會跟他合作的。但是沈默將最重要的人事權和立法行政權再次從內閣分出，交由公卿大臣共同決策，這下子就迥異於高拱那樣的獨裁者，反而給人以推誠佈公，集思廣益的感覺，這是他少受非議的重要原因。
然而只有對朝政最諳熟者纔會明白，沈默仍然掌握着說一不二的權力，因爲在六部之中，沈默的同門親信，便佔據了兵、刑、禮三尚書以及十二位侍郎中的七人。無論是廷推還是廷議，都有人數過半的優勢，這樣無論他想做什麼，還是沒有人能反對。